Алг 9: Решебник по Алгебре 9 класс (Арефьева) – Решеба

АЛГ9 |

сингапурский доллар

---

Стандартное наименование

АЛГ9 ¹

Систематическое название

ИНЛ219К

сингапурских доллара ID

SGD:S000005163

Тип элемента

ОРФ , проверено

Описание

Маннозилтрансфераза, участвующая в N-связанном гликозилировании; катализирует перенос как седьмого остатка маннозы на В-плече, так и девятого остатка маннозы на С-плече от Dol-P-Man к связанным с липидом олигосахаридам; человеческий гомолог ALG9может комплементировать нулевой мутант дрожжей; мутация человеческого гомолога вызывает врожденные нарушения гликозилирования 1 типа ^{1 2 4 5}

Название Описание

Аспарагин-связанное гликозилирование ³

Сравнительная информация

Сведения о последовательности

Последовательность

Последовательность эталонного генома S. cerevisiae получена из лабораторного штамма. S288C. Загрузите последовательность ДНК или белка, просмотрите геномный контекст и координаты. Нажмите «Сведения о последовательности», чтобы просмотреть всю информацию о последовательности для этого локуса, включая для других штаммов.

---

Анализ последовательности

Только S288C

ВЗРЫВ | БЛАСТ | Грунтовки для дизайна | Карта фрагментов ограничений | Размер фрагмента ограничения | Шестикадровый перевод

S288C по сравнению с другими видами

BLASTN против грибков | BLASTP в NCBI | BLASTP против грибков

S288C против других штаммов

Выравнивание деформации | Средство просмотра вариантов

Подробная информация о белках

Белок

Базовая информация о белке, полученная из последовательностей (длина, молекулярная масса, изоэлектрическая точка) и экспериментально определенная (среднее содержание, среднее абсолютное отклонение). Нажмите «Сведения о белке» для получения дополнительной информации о белке, такой как период полураспада, распространенность, домены, домены, общие с другими белками, поиск последовательности белка для различных штаммов, физико-химические свойства, сайты модификации белка и внешние идентификаторы для белка.

---

Длина (а.о.)

555

Мол. Вес (Да)

63786.1

Изоэлектрическая точка

8,76

Медиана численности (молекул/клетка)

3829 +/- 993

аллелей

Курируемые мутантные аллели для указанного гена, перечисленные в алфавитном порядке. Нажмите на имя аллеля, чтобы открыть страницу аллеля. Нажмите «Поиск SGD», чтобы просмотреть все аллели в результатах поиска. Нажмите «YeastMine», чтобы просмотреть все аллели в YeastMine.

---

алг9-Δ

Детали онтологии генов

Генная онтология

Аннотации GO состоят из четырех обязательных компонентов: продукта гена, термина из одного из трех Словари, контролируемые Gene Ontology (GO) (молекулярная функция, биологический процесс и Cellular Component), ссылка и код доказательства. SGD создал вручную высокопроизводительные аннотации GO, полученные из литература, а также расчетные или прогнозируемые аннотации. Нажмите «Сведения об онтологии генов», чтобы просмотреть вся информация GO и доказательства для этого локуса, а также биологические процессы, которые он разделяет с другими генами.

---

Резюме

Dol-P-Man зависимая альфа-1,2 маннозилтрансфераза, которая катализирует присоединение седьмой и девятой маннозы к липид-связанным олигосахаридам; участвует в синтезе предшественника олигосахаридов для гликозилирования N-связанного белка; локализуется в эндоплазматическом ретикулуме

Просмотр расчетных аннотаций

Молекулярная функция

Создано вручную

• позволяет dol-P-Man:Man(6)GlcNAc(2)-PP-Dol активность альфа-1,2-маннозилтрансферазы (ИДА)
• позволяет dol-P-Man:Man(8)GlcNAc(2)-PP-Dol активность альфа-1,2-маннозилтрансферазы (ИДА)
• позволяет активность маннозилтрансферазы (ИМП)

Биологический процесс

Создано вручную

• участвует в процесс биосинтеза олигосахаридов, связанных с долихолом (ИМП)
• участвует в гликозилирование белков (ИМП)
• участвует в белковое N-связанное гликозилирование (ИДА)

Сотовый компонент

Создано вручную

• часть эндоплазматический ретикулум (ИМП)

Высокая пропускная способность

• часть эндоплазматический ретикулум (ХДА)

Пути

---

Детали фенотипа

Фенотип

Аннотации фенотипа для гена представляют собой отобранные единичные мутантные фенотипы, которые требуют наблюдаемого (например, «форма клетки»), квалификатор (например, «аномальный»), тип мутанта (например, нулевой), фон штамма, и ссылка. Кроме того, аннотации классифицируются как классические генетики или высокопроизводительные. (например, крупномасштабное исследование, набор систематических мутаций). Когда это возможно, информация об аллелях и предоставляются дополнительные детали. Нажмите «Сведения о фенотипе», чтобы просмотреть все аннотации фенотипа и доказательства этого локуса, а также фенотипы, которые он разделяет с другими генами.

---

Резюме

Неосновной ген; нулевой мутант чувствителен к восстанавливающим агентам, таким как меркаптоэтанол и DTT, и демонстрирует недостаточное гликозилирование секретируемых белков; в крупномасштабных исследованиях нулевой мутант нуждается в мио-инозитоле, проявляет либо повышенную, либо пониженную конкурентоспособность в зависимости от питательной среды, демонстрирует опи-фенотип (перепроизводство и экскреция инозитола в отсутствие инозитола и холина) и имеет сниженный стойкость к высыханию и врожденная термотолерантность

Классическая генетика

ноль

• термочувствительность: повышенная
• Устойчивость к гиперосмотическому стрессу: снижена
• накопление белков/пептидов: повышенное
• модификация белков/пептидов: уменьшено
• устойчивость к химическим веществам: снижена
• жизнеспособный

не указано

• устойчивость к токсинам-убийцам: повышенная
• устойчивость к химическим веществам: снижена

Крупномасштабное обследование

ноль

• ауксотрофия
• накопление химического соединения: ненормальное
• накопление химических соединений: уменьшилось
• Экскреция химического соединения: повышенная
• хронологическая продолжительность жизни: уменьшилась
• соревновательная пригодность: снижена
• соревновательный фитнес: увеличено
• сопротивление высыханию: снижено
• эндоцитоз: снижение
• гаплопрофи
• врожденная термотолерантность: снижена
• активность белка: повышена
• секреция белка: повышена
• устойчивость к химическим веществам: снижена
• спороношение: аномальное
• стрессоустойчивость: снижена
• морфология вакуолей: аномальная
• жизнеспособный

не указано

• устойчивость к химическим веществам: повышенная

гиперэкспрессия

• вегетативный рост: сниженная скорость

Сведения о болезни

Болезнь

Аннотации болезней состоят из трех обязательных компонентов: продукта гена, термина из Онтология болезней (DO) контролируемый словарь и код доказательства. SGD предоставляет вручную созданные аннотации DO, полученные из литература. Нажмите «Сведения о заболевании», чтобы просмотреть всю информацию о заболевании и доказательства для этого локуса. как болезни он разделяет с другими генами.

---

Резюме

Дрожжевой ALG9 гомологичен человеческому ALG9/DIBD1 и использовался для изучения врожденного нарушения гликозилирования типа I и биполярного аффективного расстройства

Создано вручную

• биполярное расстройство (ИСС)
• врожденное нарушение гликозилирования I типа (ИСС, ИГИ)

Сведения о взаимодействии

Взаимодействие

Аннотации взаимодействия курируются BioGRID и включают физические или наблюдаемые генетические взаимодействия по крайней мере между двумя генами. Аннотация взаимодействия состоит из типа взаимодействия, имени интерактор, тип анализа (например, двухгибридный), тип аннотации (например, ручной или высокопроизводительный) и ссылка, а также другие детали эксперимента. Нажмите «Сведения о взаимодействии», чтобы просмотреть все взаимодействия. аннотации и доказательства для этого локуса, включая визуализацию взаимодействия.

---

Всего 487 взаимодействий для 285 уникальных генов

Физические взаимодействия

• Affinity Capture-RNA: 2
• Метка приближения-MS: 1
• Восстановленный комплекс: 1
• Двухгибридный: 6

Генетические взаимодействия

• Дефект роста дозы: 1
• Отрицательный генетический код: 389
• Фенотипическое усиление: 2
• Подавление фенотипа: 42
• Положительный Генетический: 38
• Дефект синтетического роста: 1
• Синтетическая летальность: 4

Детали регламента

Регламент

Количество предполагаемых регуляторов (генов, которые его регулируют) и мишеней (генов, которые он регулирует) для данное место, основанное на экспериментальных данных. Эти доказательства включают данные, полученные с помощью высокопроизводительные техники. Нажмите «Сведения о регулировании», чтобы просмотреть все аннотации к регулированию, общие GO. обогащение среди регулируемых целей и диаграмма регулятор/цель для локуса.

---

Регуляторы

5

Цели

0

Сведения о выражении

Выражение

Данные выражения получены из записей, содержащихся в Gene Expression Omnibus (GEO) и являются первыми log2 преобразованы и нормализованы. Ссылочные наборы данных могут содержать одно или несколько условий, и в результате может быть больше условий, чем наборов данных, представленных в одной кликабельной гистограмме бар. Деление гистограммы на уровне 0,0 отделяет условия с пониженным регулированием (зеленые) и наборы данных от те, которые активируются (красные). Нажмите «Сведения о выражении», чтобы просмотреть все аннотации выражений и детали для этого локуса, включая визуализацию генов, которые имеют сходный паттерн экспрессии.

---

Сводный абзац

Краткое изложение локуса, написанное биокураторами SGD после тщательного обзора литературы. Ссылки названия генов и кураторские термины GO включены в сводные абзацы.

---

Последнее обновление: 01.07.2005

Сведения о литературе

Литература

Вся отобранная вручную литература по указанному гену, организованная по темам в соответствии с их актуальность для гена (основная литература, дополнительная литература или обзор). Нажмите «Подробнее о литературе». для просмотра всей литературной информации по этому локусу, включая общую литературу между генами.

---

Первичный

21

Дополнительно

31

отзывов

9

Ресурсы

---

Белковая структура AlphaFold | EC2.4.1.259 | EC2.4.1.261 | Энтрез Джин | Протеин Entrez RefSeq | ФунгиБД | Искать во всех NCBI | ЮниПарк | ЮниПротКБ

Сводка экспрессии белка

ALG9 — Атлас белков человека

И НЕ

Поле
AllGene nameКласс белкаUniprot ключевое словоChromosomeExternal idТканевая экспрессия (IHC)Идентификатор пациента (IHC)Категория ткани (РНК)Кластер тканевой экспрессии (РНК)Оценка надежности ткани (IHC)Категория области мозга (РНК)Категория мозга мыши (РНК)Категория мозга свиньи ( РНК)Оценка надежности мозга мышиКатегория типа клеток (РНК)Кластер экспрессии единичного типа клеток (РНК)Обогащение типа клеток (РНК)Прогностический ракКатегория рака (РНК)Категория иммунных клеток (РНК)Категория линии иммунных клеток (РНК)Кластер экспрессии иммунных клеток (РНК) )Аннотация секретомаПанель панракаСубклеточная локализация (ICC)Субклеточная локализация — клеточная линия (ICC)Пик фазы субклеточного клеточного циклаОценка клеток (ICC)Категория клеточной линии (РНК)Кластер экспрессии клеточной линии (РНК)Метаболический путьСводка доказательствДоказательства UniProtДоказательства NextProtДоказательства HPAБелковый массив (PA )Вестерн-блот (WB)Иммуногистохимия (IHC)Иммуноцитохимия (ICC)С антителамиБелковые структурыИмеет данные о белкахСортировать по

Gene name

Class
Blood group antigen proteinsCancer-related genesCandidate cardiovascular disease genesCD markersCitric acid cycle related proteinsDisease related genesEnzymesFDA approved drug targetsG-protein coupled receptorsHuman disease related genesImmunoglobulin genesMapped to neXtProtMapped to UniProt SWISS-PROTMetabolic proteinsNuclear receptorsPlasma proteinsPotential drug targetsPredicted intracellular proteinsPredicted мембранные белкиПредсказанные секретируемые белкиДоказательства белков (Ezkurdia et al 2014)Доказательства белков (Kim et al 2014)Белки, связанные с путем RASРибосомные белкиБелки, связанные с РНК-полимеразойГены Т-клеточных рецепторовТранскрипционные факторыТранспортерыПотенциальнозависимые ионные каналы

Subclass

Class
Biological processMolecular functionDisease

Keyword

Chromosome
12345678910111213141516171819202122MTUnmappedXY

External id

Tissue
AnyAdipose tissueAdrenal glandAppendixBone marrowBreastBronchusCartilageCaudateCerebellumCerebral cortexCervixChoroid plexusColonDorsal rapheDuodenumEndometriumEpididymisEsophagusEyeFallopian tubeGallbladderHairHeart muscleHippocampusHypothalamusKidneyLactating breastLiverLungLymph nodeNasopharynxOral mucosaOvaryPancreasParathyroid glandPituitary glandPlacentaProstateRectumRetinaSalivary glandSeminal vesicleSkeletal muscleSkinSmall intestineSmooth muscleSoft tissueSole of ступняСелезенкаЖелудокЧерная субстанцияЯичкиВилочковая железаЩитовидная железаМиндалиныМочевой пузырьВлагалище

Cell type

Expression

Patient ID

Tissue
AnyAdipose tissueAdrenal glandBone marrowBrainBreastCervixChoroid plexusEndometriumEpididymisEsophagusFallopian tubeGallbladderHeart muscleIntestineKidneyLiverLungLymphoid tissueOvaryPancreasParathyroid glandPituitary glandPlacentaProstateRetinaSalivary glandSeminal vesicleSkeletal muscleSkinSmooth muscleStomachTestisThyroid glandTongueUrinary bladderVagina

Category
Обогащенная тканьОбогащенная группаОбогащенная тканьНизкая тканевая специфичностьНе обнаруженоОбнаружено у всехОбнаружено у многихОбнаружено у некоторыхОбнаружено у единичныхСамая высокая экспрессия

Кластер
82: Жировая ткань — Организация внеклеточного матрикса17: Надпочечники — Метаболизм стероидов14: В-клетки — Гуморальный иммунный ответ75: Костный мозг — сплайсинг мРНК Клеточный цикл 65: Мозг — Транспорт ионов 70: Мозг — Развитие нервной системы 10: Мозг — Нейрональная сигнализация 73: Мозг — Нейропептидная сигнализация 6: Мозг — Восприятие запаха 58: Мозг — Синаптическая функция 76: Мозг и костный мозг — Организация хроматина 32: Мозг и лимфоидная ткань — Неизвестная функция 27: Мозг и кожа — неизвестная функция5: Грудь — неизвестная функция69:Мозжечок – Регуляция экспрессии генов88:Сосудистое сплетение – Трансмембранный транспорт42:Реснитчатые клетки – Реснички и проекции клеток49:Реснитчатые клетки – Организация ресничек30:Эпидидимис – Антимикробная активность68:Эпидидимис – Неизвестная функция84:Пищевод – Функция эпителиальных клеток89:Фибробласты – Организация внеклеточного матрикса44:Сердце – Сокращение сердечной мышцы 38: Сердце — сокращение мышц 16: Иммунные клетки — Иммунный ответ 45: Кишечник — Щеточная граница 56: Кишечник — Трансмембранный транспорт 37: Кишечник — Неизвестная функция 87: Кишечник и почки — Трансмембранный транспорт 41: Кишечник и печень — Метаболизм липидов 7: Почки — Трансмембранный транспорт 81: Почки & Печень — Метаболизм62:Печень — Гемостаз60:Печень — Гемостаз и метаболизм липидов85:Печень — Метаболизм86:Печень и плацента — Транспорт через ER19: Легкие — функция легких66: лимфоидная ткань — регуляция иммунного ответа 64: макрофаги — иммунный ответ 67: нейтрофилы — гуморальный иммунный ответ 40: нейтрофилы — воспалительный ответ 57: неспецифический — ангиогенез 53: неспецифический — регуляция клеточного цикла 54: неспецифический — организация микротрубочек 39: Неспецифические — Митохондрии55:Неспецифические — Митохондрии и протеасомы52:Неспецифические — Рибосомы72:Неспецифические — Транскрипция59:Неспецифические — Трансляция51:Неспецифические — Неизвестная функция29:Неспецифические — Везикулярный транспорт25:Поджелудочная железа — Пищеварение48: Паращитовидная железа — мембранные белки 26: Гипофиз — Гормональная сигнализация 28: Плацента — Беременность 79:Сетчатка — Фототрансдукция77:Сетчатка — Зрительное восприятие20:Сетчатка и лимфоидные ткани — Неизвестная функция24:Слюнные железы — Слюнная секреция61:Кожа — Ороговение31:Кожа — Развитие эпидермиса12:Гладкая мышечная ткань — Смешанная функция11:Плоскоклеточные эпителиальные клетки — Функция эпителиальных клеток4:Желудок — Пищеварение 33: Поперечно-полосатые мышцы — Сокращение мышц 80: Поперечно-полосатые мышцы — Неизвестная функция 63: Т-клетки — Адаптивный иммунный ответ 23: Яички — Регуляция клеточного цикла 71: Яички — Репарация ДНК 83: Яички — Сперматогенез 43: Яички — Неизвестная функция 1: Щитовидная железа — Транскрипция

Reliability
EnhancedSupportedApprovedUncertain

Brain region
AnyAmygdalaBasal gangliaCerebellumCerebral cortexHippocampal formationHypothalamusMedulla oblongataMidbrainPonsSpinal cordThalamusWhite matter

Category
Region enrichedGroup enrichedRegion enhancedLow region specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleIs highest expressed

Brain region
AnyAmygdalaBasal gangliaCerebellumCerebral cortexHippocampal formationHypothalamusMidbrainOlfactory bulbPituitary glandPons and продолговатый мозгСетчаткаТаламусБелое вещество

Category
Region enrichedGroup enrichedRegion enhancedLow region specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleIs highest expressed

Brain region
AnyAmygdalaBasal gangliaCerebellumCerebral cortexHippocampal formationHypothalamusMedulla oblongataMidbrainOlfactory bulbPituitary glandPonsRetinaSpinal cordThalamusWhite matter

Category
Region enrichedGroup enrichedRegion enhancedLow region specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleНаиболее выражено

Reliability
SupportedApproved

Cell type
AnyAdipocytesAlveolar cells type 1Alveolar cells type 2AstrocytesB-cellsBasal keratinocytesBasal prostatic cellsBasal respiratory cellsBasal squamous epithelial cellsBipolar cellsBreast glandular cellsBreast myoepithelial cellsCardiomyocytesCholangiocytesClub cellsCollecting duct cellsCone photoreceptor cellsCytotrophoblastsDendritic cellsDistal enterocytesDistal tubular cellsDuctal cellsEarly spermatidsEndometrial ciliated cellsEndometrial stromal cellsEndothelial cellsEnteroendocrine cellsErythroid cellsExcitatory нейроны Экзокринные железистые клетки Экстраворсинчатые трофобласты Фибробласты Желудочные слизесекретирующие клетки Железистые и просветные клетки Гранулоциты Гранулезные клетки Гепатоциты Клетки Хофбауэра Горизонтальные клетки Тормозные нейроны Бокалокишечные клетки Ионоциты Клетки Купфера Клетки Лангерганса cyte precursor cellsOligodendrocytesPancreatic endocrine cellsPaneth cellsPeritubular cellsPlasma cellsProstatic glandular cellsProximal enterocytesProximal tubular cellsRespiratory ciliated cellsRod photoreceptor cellsSalivary duct cellsSchwann cellsSerous glandular cellsSertoli cellsSkeletal myocytesSmooth muscle cellsSpermatocytesSpermatogoniaSquamous epithelial cellsSuprabasal keratinocytesSyncytiotrophoblastsT-cellsTheca cellsThymic epithelial cellsUndifferentiated cells

Category
Cell type enrichedGroup enrichedCell type enhancedLow cell type specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleIs highest expressed

Tissue
Adipose subcutaneousAdipose visceralBreastColonHeart muscleKidneyLiverLungPancreasProstateSkeletal muscleSkinStomachTestisThyroid

Cell type

Enrichment
Very highHighModerate

Cancer
Breast cancerCervical ракКолоректальный ракРак эндометрияГлиомаРак головы и шеиРак печениРак легкихМеланомаРак яичниковРак поджелудочной железыРак простатыРак почкиРак желудкаРак яичекРак щитовидной железыРак мочевого пузыря

Prognosis
FavorableUnfavorable

Cancer
AnyBreast cancerCervical cancerColorectal cancerEndometrial cancerGliomaHead and neck cancerLiver cancerLung cancerMelanomaOvarian cancerPancreatic cancerProstate cancerRenal cancerStomach cancerTestis cancerThyroid cancerUrothelial cancer

Category
Cancer enrichedGroup enrichedCancer enhancedLow cancer specificityNot detectedDetected in allDetected in manyDetected in someDetected in singleIs highest expressed

Тип клеток
ЛюбыеБазофилыКлассические моноцитыЭозинофилыGdT-клеткиПромежуточные моноцитыMAIT Т-клеткиВ-клетки памяти CD4 Т-клетки памяти CD8 Т-клеткиМиелоидные DCN-наивные В-клеткиНаивные CD4-Т-клеткиНаивные CD8-клеткиНейтрофилы NK-клеткиНеклассические моноцитыПлазмацитоид Категория Обогащено клеткамиГрупповое обогащениеУсиление иммунных клетокНизкая специфичность иммунных клетокНе обнаружено в иммунных клеткахНе обнаруженоОбнаружено во всехОбнаружено во многихОбнаружено в некоторыхОбнаружено в единичныхИмеет наивысшую экспрессию

Клеточная линия
Любые В-клетки Дендритные клетки Гранулоциты Моноциты NK-клетки Т-клетки иммунный ответ43:В-клетки — гуморальный иммунный ответ37:В-клетки — транскрипция24:В-клетки — неизвестная функция41:базофилы — клеточное дыхание46:базофилы — связывание ДНК38:базофилы — неизвестная функция18:базофилы — везикулярный транспорт45:эозинофилы — врожденный иммунный ответ52: Эозинофилы — Транскрипция49:Эозинофилы — неизвестная функция36:GdT-клетки — адаптивный иммунный ответ5:гранулоциты — неизвестная функция16:MAIT-клетки — неизвестная функция25:моноциты — воспалительный ответ51:моноциты — врожденный иммунный ответ14:моноциты — неизвестная функция28:миелоидные ДК — неизвестная функция50:нейтрофилы — Клеточное старение 33: Нейтрофилы — Организация хроматина 8: Нейтрофилы — Воспалительный ответ 9: Нейтрофилы — Врожденный иммунный ответ 1: Нейтрофилы — Смешанная функция 15: NK-клетки — Транскрипция 48: NK-клетки — Неизвестная функция 12: Неспецифические — Основные клеточные процессы 27: Неспецифические — Ген выражение31: неспецифический — воспалительный ответ26: неспецифический — митохондрии39:Неспецифический — процессинг мРНК44:Неспецифический — Транскрипция30:Неспецифический — Трансляция47:Плазмоцитоидные ДК — Сворачивание белка29:Плазмоцитоидные ДК — Неизвестная функция20:Т-клетки — Т-клеточный рецептор32:Т-клетки — Неизвестная функция4:Т- regs — Регуляция клеточного цикла35:T-regs — Функция неизвестна

Аннотация
Гены иммуноглобулинов Внутриклеточные и мембранныеСекретируются — местонахождение неизвестноСекретируются в головном мозгеСекретируются в женской репродуктивной системеСекретируются в мужской репродуктивной системеСекретируются в других тканяхСекретируются в кровьСекретируются в пищеварительную системуСекретируются во внеклеточный матрикс

Disease
AnyAcute myeloid leukemiaBreast cancerCervical cancerChronic lymphocytic leukemiaColorectal cancerDiffuse large B-cell lymphomaEndometrial cancerGliomaLung cancerMyelomaOvarian cancerProstate cancer

Location
Actin filamentsAggresomeCell JunctionsCentriolar satelliteCentrosomeCleavage furrowCytokinetic bridgeCytoplasmic bodiesCytosolEndoplasmic reticulumEndosomesFocal adhesion sitesGolgi apparatusIntermediate filamentsKinetochoreLipid dropletsLysosomesMicrotubule endsMicrotubulesMidbodyMidbody ringMitochondriaMitotic chromosomeMitotic spindleNuclear bodiesNuclear membraneNuclear specklesNucleoliNucleoli fibrillar centerNucleoli rimNucleoplasmPeroxisomesPlasma membraneRods & КольцаВезикулы

Searches
EnhancedSupportedApprovedUncertainIntensity variationSpatial variationCCD protein mitotic structureCCD protein interphaseCell cycle dependent proteinCell cycle independent proteinCell cycle dependent transcriptCell cycle independent transcriptMultilocalizingLocalizing 1Localizing 2Localizing 3Localizing 4Localizing 5Localizing 6Main locationAdditional location

Location
AnyActin filamentsAggresomeCell JunctionsCentriolar satelliteCentrosomeCleavage furrowCytokinetic bridgeCytoplasmic bodiesCytosolEndoplasmic reticulumEndosomesFocal adhesion sitesGolgi apparatusIntermediate filamentsKinetochoreLipid dropletsLysosomesMicrotubule endsMicrotubulesMidbodyMidbody кольцоМитохондрииМитотическая хромосомаМитотическое веретеноЯдерные тельцаЯдерная мембранаЯдерные спеклыЯдрышкиЯдрышковый фибриллярный центрОбод ядрышкаНуклеоплазмаПероксисомыПлазматическая мембранаПалочки и кольцаВезикулы

Cell line
AnyA-431A-549AF22ASC52teloBJ [Human fibroblast]CACO-2EFO-21FHDF/TERT166GAMGHaCaTHAP1HBEC3-KTHBF/TERT88HDLM-2HEK293HELHeLaHep-G2HTCEpiHTEC/SVTERT24-BHTERT-HME1HTERT-RPE1HTERT-RPE1 (serum starved)HUVEC/TERT2JURKATK-562LHCN-M2MCF -7NB4OE19PC-3REHRh40RPTEC/TERT1RT-4SH-SY5YSiHaSK-MEL-30SuSaTHP-1U-251MGU2OS

Type
ProteinRna

Phase
G1SG2

Reliability
EnhancedSupportedApprovedUncertain

Cancer type
AnyBile duct cancerBladder cancerBone cancerBrain cancerBreast cancerCervical cancerColorectal cancerEsophageal cancerGallbladder cancerGastric cancerHead и рак шеиРак почкиЛейкемияРак печениРак легкихЛимфомаМиеломаНейробластомаНезлокачественныйРак яичниковРак поджелудочной железыРабдоидСаркомаРак кожиРак яичкаРак щитовидной железыБез категорииРак матки

Категория
Обогащенный ракГрупповой обогащенныйРак усиленныйНизкая специфичность ракаНе обнаруженоОбнаружено у всехОбнаружено у многихОбнаружено у некоторыхОбнаружено у единичныхИмеет наивысшую экспрессию Транскрипция 28: Рак кости CADO-ES1 — Передача сигналов глутамата 65: Рак молочной железы — Неизвестная функция 20: Клетки соединительной ткани — Организация ECM2: DU4475 — Неизвестная функция 59:Фибробласты – Метаболизм62:Гранулоциты – Врожденный иммунный ответ3:HUVEC и ВРЕМЯ – Трансдукция сигнала60:Кератиноциты – Функция эпителиальных клеток68:Почки – Смешанная функция50:L-1236 и L-428 – Неизвестная функция61:Печень – Метаболизм35:Рак печени – Метаболизм12:Лимфоид рак — Адаптивный иммунный ответ 9: Лимфоидный рак — Иммунный ответ 11: Лимфома — Адаптивный иммунный ответ 54: Лимфома — Передача сигналов цитокинов 64: Лимфома — Гуморальный иммунный ответ 66: Миелоидные клетки — Врожденный иммунный ответ 32: Миелоидный лейкоз — Транспорт кислорода 51: Миелома — Гуморальный иммунный ответ 26: NCI- H716 — Функция неизвестна 21: Нейробластома — Нейрональная сигнализация7: Нейрональные клеточные линии — Стереоцилия56: Нейроны — Нейрональная сигнализация30: Неспецифический — Противовирусный иммунный ответ58: Неспецифический — Основные клеточные процессы45: Неспецифический — Пролиферация клеток41:Неспецифический — Сборка реснички40 :Неспецифический — Ферменты43:Неспецифический — Митохондрии67:Неспецифический — Митохондрии и связывание РНК53:Неспецифический — процессинг мРНК13:Неспецифический — Nuc Процессы обучения1: Неспецифический — Сборка нуклеосом15: Неспецифический — Связывание с белками48: Неспецифический — Связывание с РНК31: Неспецифический — Транскрипция57: Неспецифический — Трансляция63: Неспецифический — Неизвестная функция10: Рак яичников и эндометрия — Неизвестная функция37 : Рак яичников RMG-I — Реакция на клеточный стресс24: Рак предстательной железы — Липидный обмен 34: Рабдоидный рак — Эмбриональное развитие 47: Сетчатка — Зрительное восприятие 22: Рабдоидный рак — Нейрональная передача сигналов17: RS4; 11 — Неизвестная функция42: Саркома — Сокращение мышц 16: Рак кожи — Меланоциты процессы33:Рак кожи — Компоненты мембраны52:Сперматиды — Восприятие запаха19:Рак желудка и толстой кишки — Поглощение27:TE 441. T — Функция неизвестна29:TT и NCI-h2385 — Синаптическая передача сигнала

Путь
Гидролиз ацил-КоА Метаболизм ацилглицеридовАланин; Метаболизм аспартата и глутамата Метаболизм аминосахара и нуклеотидного сахара Биосинтез аминоацил-тРНК Метаболизм андрогенов Метаболизм арахидоновой кислоты Метаболизм аргинина и пролина Метаболизм аскорбата и альдарата Бета-окисление жирных кислот с разветвленной цепью (митохондриальное) Бета-окисление ди-ненасыщенных жирных кислот (n-6) (митохондриальное) Бета-окисление диненасыщенные жирные кислоты (n-6) (пероксисомальные)Бета-окисление жирных кислот с четной цепью (митохондриальное)Бета-окисление жирных кислот с четной цепью (пероксисомальное)Бета-окисление жирных кислот с нечетной цепью (митохондриальное)Бета-окисление фитановых кислотное (пероксисомальное)Бета-окисление полиненасыщенных жирных кислот (митохондриальное)Бета-окисление ненасыщенных жирных кислот (n-7) (митохондриальное)Бета-окисление ненасыщенных жирных кислот (n-7) (пероксисомальное)Бета-окисление ненасыщенных жирных кислот ( п-9) (митохондриальный) Бета-окисление ненасыщенных жирных кислот (n-9) (пероксисомальный) Метаболизм бета-аланина Биосинтез желчных кислот Рециркуляция желчных кислот Метаболизм биоптерина Метаболизм биотина Биосинтез группы крови Метаболизм бутаноатов Метаболизм двухосновных кислот с разветвленной цепью C5 )Карнитиновый челнок (пероксисомальный)Биосинтез холестерина 1 (путь Блоха)Биосинтез холестерина 2Биосинтез холестерина 3 (путь Кандуща-Рассела)Метаболизм холестеринаБиосинтез хондроитина/гепарансульфатаХондроитинсульфатная деградацияКоАсинтезЦистеин и метионинметаболизмЛекарственный метаболизмЭйкозаноидный метаболизмЭстрогенный метаболизмЭфирный липидный обменАктивация жирных кислот (цитозольная)Активация жирных кислот ( эндоплазматический ретикулярный)Биосинтез жирных кислотБиосинтез жирных кислот (четная цепь)Биосинтез жирной кислоты (нечетная цепь)Биосинтез жирной кислоты (ненасыщенный)Десатурация жирной кислоты (четная цепь)Десатурация жирной кислоты n (нечетная цепь) Удлинение жирных кислот (четная цепь) Удлинение жирных кислот (нечетная цепь) Окисление жирных кислот Метаболизм фолиевой кислоты Образование и гидролиз эфиров холестерина Метаболизм фруктозы и маннозы Метаболизм галактозы Биосинтез глюкокортикоидов Метаболизм глутатиона Метаболизм глицеролипидов Метаболизм глицерофосфолипидов Глицин; serine and threonine metabolismGlycolysis / GluconeogenesisGlycosphingolipid biosynthesis-ganglio seriesGlycosphingolipid biosynthesis-globo seriesGlycosphingolipid biosynthesis-lacto and neolacto seriesGlycosphingolipid metabolismGlycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesisHeme degradationHeme synthesisHeparan sulfate degradationHistidine metabolismInositol phosphate metabolismIsolatedKeratan sulfate biosynthesisKeratan sulfate degradationLeukotriene metabolismLinoleate metabolismLipoic acid metabolismLysine metabolismMetabolism of other amino acidsMiscellaneousN-glycan metabolismNicotinate и метаболизм никотинамида Метаболизм нуклеотидов Метаболизм О-гликанов Метаболизм омега-3 жирных кислот Метаболизм омега-6 жирных кислот Окислительное фосфорилирование Биосинтез пантотената и КоА Пентозо- и глюкуронатные взаимопревращения Пентозофосфатный путь Метаболизм фенилаланина Фенилаланин; tyrosine and tryptophan biosynthesisPhosphatidylinositol phosphate metabolismPool reactionsPorphyrin metabolismPropanoate metabolismProstaglandin biosynthesisProtein assemblyProtein degradationProtein modificationPurine metabolismPyrimidine metabolismPyruvate metabolismRetinol metabolismRiboflavin metabolismROS detoxificationSerotonin and melatonin biosynthesisSphingolipid metabolismStarch and sucrose metabolismSteroid metabolismSulfur metabolismTerpenoid backbone biosynthesisThiamine metabolismTransport reactionsTricarboxylic acid cycle and glyoxylate/dicarboxylate metabolismTryptophan metabolismTyrosine metabolismUbiquinone synthesisUrea cycleValine; лейцин; и изолейцина Метаболизм витамина А Метаболизм витамина В12 Метаболизм витамина В2 Метаболизм витамина В6 Метаболизм витамина С Метаболизм витамина D Метаболизм витамина Е Метаболизм ксенобиотиков

Категория
Доказательства на уровне белка Доказательства на уровне транскрипта Нет доказательств человеческого белка/транскрипта

Балл
Доказательства на уровне белка Доказательства на уровне транскрипта Нет доказательств человеческого белка/транскрипта Оценка
Доказательство на уровне белка Доказательство на уровне транскрипта Нет доказательств человеческого белка/транскрипта

Валидация
Поддержано Утверждено Неопределенно

Validation
Enhanced — CaptureEnhanced — GeneticEnhanced — IndependentEnhanced — OrthogonalEnhanced — RecombinantSupportedApprovedUncertain

Validation
Enhanced — IndependentEnhanced — OrthogonalSupportedApprovedUncertain

Validation
Enhanced — GeneticEnhanced — IndependentEnhanced — RecombinantSupportedApprovedUncertain

Antibodies
YesNo

Protein structure
ExperimentalPrediction

In atlas
TissueCellPathologyBrainBlood — конц.